Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms