Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN18Q96SJ8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms