Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARXQ96QS3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms