Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGAP1Q96PV0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms