Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLUHP3Q96NS8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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