Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms