Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms