Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms