Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms