Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1AQ96AJ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms