Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM54Q969K7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms