Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-CQ95604 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-CQ95604 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-CQ95604 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-CQ95604 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-CQ95604 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-CQ95604 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-CQ95604 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-CQ95604 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms