Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO1Q92973 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms