Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC4Q92889 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms