Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms