Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF31Q8WWY3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms