Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDI1Q8WTU0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms