Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDM1Q8NG50 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDM1Q8NG50 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDM1Q8NG50 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDM1Q8NG50 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDM1Q8NG50 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDM1Q8NG50 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms