Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms