Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC155Q8N6L0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms