Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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