Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms