Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LOXHD1Q8IVV2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXHD1Q8IVV2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms