Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms