Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC6Q7Z403 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms