Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms