Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q71RC1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q71RC1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q71RC1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q71RC1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q71RC1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q71RC1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q71RC1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q71RC1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q71RC1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q71RC1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q71RC1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q71RC1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms