Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRCAPQ6ZRS2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRCAPQ6ZRS2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms