Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms