Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFXL1Q6ZNB6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms