Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms