Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6Q795 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6Q795 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q6Q795 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms