Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms