Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNS3Q68CZ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms