Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACHD1Q5VU97 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACHD1Q5VU97 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms