Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC3LQ5T215 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms