Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIVEP3Q5T1R4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIVEP3Q5T1R4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms