Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1BQ5T0F9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1BQ5T0F9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms