Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
FRMPD1Q5SYB0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms