Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1Q5SRE7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms