Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAT1Q5SQI0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATAT1Q5SQI0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms