Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDK2Q58EX2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms