Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms