Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP13A4Q4VNC1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms