Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP19-7Q3SYF9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms