Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00303Q3SY05 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms