Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
QSER1Q2KHR3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
QSER1Q2KHR3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms