Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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