Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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