Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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GEN1Q17RS7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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GEN1Q17RS7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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GEN1Q17RS7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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